李奇渊

发布日期:2022-11-22     点击数:

李奇渊丹麦科技大学获博士学位,后又在美国哈佛医学院从事博士后研究,期间,以共同第一作者身份在Nature Medicine上发表了论文。

担任厦门大学健康医疗大数据国家研究院副院长;同时担任厦门大学附属第一医院儿科科研外聘主任,支持儿科智能化研究。以第一作者和通讯作者的身份在Cell、Nature communication、Cancer Research、EBioMedicine等国际知名期刊上发表论文。


李奇渊教授主要致力于生物信息统计方面的研究,目前的主要研究方向包括:

1. 运用统计学模型从遗传多态性,体细胞变异,表观基因组学和基因表达等多组学数据中寻找与肿瘤分型,预后,靶向治疗敏感性等临床特征有关的决定因子并解释其调控机制;在此基础上建立基于多组学关联的复杂网络模型,应用人工智能方法发现新的肿瘤驱动基因。

2. 基于图神经网络的跨细胞系染色质三维结构预测,利用GCN框架预测跨细胞系Hi-C数据和表达数量性状位点(Expression Quantative Trait Loci, eQTL)。

3. 单细胞转录组算法研究:基于K-means和Louvain的大型单细胞聚类算法;基于最小无偏代表点(MURP)的降采样算法;基于单细胞转录组的时间分化轨迹研究;基于单细胞转录组的空间重构。

4. 利用单细胞测序技术研究母胎界面免疫微环境中T淋巴细胞演进路线的重建及其转录调控;利用单细胞测序技术研究吸烟对于肺癌免疫微环境的影响。

5. 基于无创产前检测(NIPT)的体细胞突变图谱与肿瘤的关联性研究。

厦门市医保定点医药机构布局规划专项业务,本项目应用网格化地理信息管理和大数据技术,实现对厦门市参保人口医保资源有效供给的精准化评价和管理,对厦门市新增定点医疗机构和药店的地理设置提供实时评估和咨询;向医保管理部门和社会提供实时精准的资源呈现,为医保定点医疗机构存量管理和增量规划提供统计依据。


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