一、案例介绍

下图数据为A基因和B基因的表达量（范例数据为随机数据，无生物学意义），根据数据作基因表达相关性散点图。

二、软件操作方法

1、打开Graphpad Prism软件，图表类型选择“XY”，勾选“Enter and plot a single Y value for each point”，点击“Creat”创建新图表。（图1）

图1 创建XY图表

2、写入/导入数据（图2）。

图2 数据录入

3、找到Graphs（图3），点击以上数据对应的名称，就可生成图形。

图3 生成图形

4、点击Analysis中的“Fit a line with the linear regression”，对线性回归的数据和参数进行设置。一般不需要做任何个性化设置，点击OK后即可获得A基因和B基因的相关性趋势曲线。（图4）

图4-1 添加相关性趋势线

图4-2 添加相关性趋势线

图4-3 添加相关性趋势线

5、查看统计结果：点击“Result”选择中“Linear reg. of data 1”，R²和P值（图5），分别代表数据的线性情况和显著性。其中：r为相关性系数，r的值介于+1和-1之间，其绝对值越靠近1说明相关性越强，正负表示相关的方向，正值说明为正相关，负值说明为负相关。

图5 查看统计分析结果

6、图形调整与优化：（1）调整命名，可选择删除Data1、X title和Y title标题，重新命名；（2）可以利用change版块调整图片，也可以直接双击图形/坐标轴修改图片大小、颜色、X轴Y轴等信息；（3）绘制好的图形中添加R²和P值。（图6）

图6 图形优化