黄丙丁 (1937.5-1937.10任院长)

1935年参加福建省立医院（第一医院前身）筹建，福建晋江人，医学博士，留学日本，皮肤病专家

李鼎勋 (1937.10-1943.2任院长)

兼任福建省医学院院长，湖南人，日本东京大学博士，泌尿系统疾病专家

王志超 (1943.2-1956.6任院长)

辽宁辽阳人，普外科专家， 率领省立医院由南平搬迁至厦门

林荣年 (1956.6-1966.6任院长)

福建平和县人，皮肤科专家。解放前夕参加地下党，为厦门解放做出突出贡献

鞠昆圃 (1966.6-1970.3任院长)

山东潍坊人，曾在31军92师任卫生科科长，亲历淮海战役、渡江战役等重大战役，屡立战功

黄锡隆 (1970.3-1977.10任副院长)

福建南安县人，1939年毕业于湖南湘雅医学院，奠定了我省胸外科基础。1984年聘请为第一医院名誉院长

王农 (1978.7-1981.1任第一副院长)

（当时无正职院长），山东海阳人，曾在六七二二部队卫生连任连长，外科专家

骆树民 (1984.8-1992.4任院长)

福建惠安人，毕业于山东医学院，主任医师，副教授，硕士生导师，肿瘤外科专家，享受国务院政府特殊津贴

叶刚 (1995.1-2001.10任院长)

江苏沭阳人，毕业于安徽医学院，主任医师，教授，胸外科专家。

商少宏 (2001.10-2005.4任院长)

福建泉州市人，毕业于福建医学院医疗系，主任医师，教授，消化内科专家

杨叔禹 (2005.7-2012.09任院长)

辽宁沈阳人,主任医师,教授,博士生导师，中西医结合专业,获2006年度“中国医院优秀院长”、“第六届中国医师奖”，享受国务院政府特殊津贴

姜杰 (2012.09- 2019.12任院长)

主任医师、教授、硕士研究生导师、厦门市拔尖人才，长期从事胸外科临床工作，获厦门市第二届林巧稚奖章称号

王占祥（2020.03- 2024.11 任院长)

医学博士、教授、主任医师、博士生导师，博士后指导老师，留学归国人才。中国医疗行业最高奖“中国医师奖”获得者，享受国务院特殊津贴，入选省新世纪百千万人才工程，被评为福建省优秀留学归国人员

张福星（2024.12- 至今 任院长)

博士，主任医师，教授，厦门市本土领军人才。中国医师协会外科医师分会委员，中国医疗保健国际交流促进会理事、外科学分会常委兼副秘书长，全国卫生产业企业管理协会疝和腹壁外科产业及临床研究分会常务理事兼第26专家组组长，中国研究型医院学会甲状腺疾病专业委员会委员。