GraphPad Prism绘制热图

发布日期:2025-01-20     点击数:

一、案例数据

热图(Heatmaps)是将数据矩阵中的各个值按一定规律映射为颜色来进行展示,利用颜色变化实现数据的可视化。通过热图,我们可以快速地了解数据的分布规律、热点区域以及密度变化情况,为图像分析提供直观的参考依据。根据下列范例数据(范例数据为随机数据,无生物学意义),利用GraphPad Prism软件绘制热图。

二、软件操作方法

1、图表选项

1.1 打开Graphpad Prism软件,图表类型选择“Grouped”;

1.2 勾选“Enterorimport data into a new table”;

1.3 Options选择“Enter and plot a single Y value for each point”;

1.4 点击“Creat”创建新图表。(图1)

图1 创建图表

2、写入/导入数据(图2)。

图2 数据录入

3、在左侧项目列表中Graphs处选择Date 1,图表类型选择“Heat Map”,并在其中选择一种配色方案,即可初步得到绘制的热图。(图3)

图3 生成曲线图形

4、图形调整与优化:

4.1 颜色设置:双击绘图区域,打开Format Graph窗口,在Color mapping选项卡下,修改Colormap为“Doublegradient”,在Range选项下可修改颜色范围,也可自定义最小值和最大值。(图4-1)

图4-1 热图颜色修改

4.2 坐标设置:在Format Graph窗口中点击“Labels”,“Row Labels”中修改横坐标标签信息,Mark选项选择“Every”,可以在“Font”中修改字体;“Column Labels”修改如同“Row Labels”。修改后点击“Apply”。(图4-2)

图4-2 横纵坐标标签信息修改

4.3 热图边框修改:切换至Graph Settings选项卡,修改Heatmap borders的粗细为“1 pt”,即热图边框的粗细,也可修改颜色。勾选“Cell borders”可显示每个单元格的边框,如图4-3。

图4-3 热图边框修改

4.4 显示坐标标题:切换至“Titles”选项卡,勾选“Show row labels title”和“Show column labels title”即可。(图4-4)

图4-4 热图坐标标题修改

5 若需要对热图添加间隙,可打开Format Graph窗口,点击Gaps选项,对“Vertical gaps”和“Horizontal gaps”进行编辑,比如我们需要横向和纵向都进行分组,可以如图5进行设置。

图5 热图添加间隙设置

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